Focus tecnico: Chimica

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Credito: Megaflopp/Shutterstock

Focus tecnico: Chimica

Una carrellata degli ultimi software di chimica a disposizione dei ricercatori

Considerati gli enormi costi e i lunghi tempi di sviluppo associati all’immissione di nuovi farmaci sul mercato, è stata sviluppata un’ampia selezione di strumenti software per aiutare le organizzazioni farmaceutiche a sviluppare in modo più efficace ed efficiente nuovi farmaci candidati.

In un mercato così estremamente competitivo, anche l’immissione sul mercato di un farmaco con qualche mese di anticipo può incidere sostanzialmente sulla redditività. Allo stesso modo, battute d’arresto e ritardi nel processo di sviluppo e ricerca possono avere un impatto notevole sul costo potenziale di farmaci di successo o sul successo assoluto di un nuovo composto.

Oggi esistono diverse categorie di strumenti software, dalla cura dei dati alla relazione quantitativa struttura-attività (QSAR) e persino strumenti specializzati basati su ligandi.

Esiste anche un numero crescente di opzioni software basate sull’intelligenza artificiale e sul deep learning che offrono un enorme potenziale per accelerare la pipeline di scoperta.

Digitalizzare la conoscenza della chimica analitica

I dati analitici sono fondamentali per le decisioni critiche prese ogni giorno. Con gli attuali sistemi informatici, tuttavia, i dati sono ancora bloccati in silos specializzati o eccessivamente astratti in testi e immagini difficili da riutilizzare. Digitalizza e centralizza le conoscenze analitiche raccolte nei tuoi laboratori con la piattaforma Spectrus, l'ambiente informatico ricercabile che parla il linguaggio dei dati analitici.

La piattaforma Spectrus fornisce:

Per saperne di più: www.acdlabs.com/ADM

ACD/Lab sviluppa le piattaforme software Spectrus e Percepta per supportare la ricerca nella scoperta di farmaci. L'ultima versione di Spectrus fornisce funzionalità per output strutturati leggibili dalle macchine, che hanno il potenziale per assistere le parti interessate nelle organizzazioni di ricerca e sviluppo con aspirazioni a digitalizzare i flussi di lavoro di laboratorio, ridurre il grado di processo decisionale basato sui documenti e mitigare il rischio di trasposizione manuale dei dati .

Questi nuovi progressi nella piattaforma software aiutano a fornire nuove funzionalità agli scienziati che includono: supporto decisionale, flusso di dati migliorato e integrazioni hardware/software; espansione del controllo dello strumento e espansione delle tecnologie basate su browser.

Fondata nel 2018,Alvasciencesta cercando di aumentare il valore della ricerca chimicoinformatica attraverso soluzioni software ad alta tecnologia che utilizzano l’apprendimento automatico e altri strumenti scientifici.

Partendo dalla data curation (alvaMolecule), al calcolo di descrittori molecolari e impronte digitali (alvaDesc), alla modellazione di regressione e classificazione (alvaModel), all'implementazione dei modelli (alvaRunner), alla progettazione molecolare de novo (alvaBuilder), è possibile utilizzare i prodotti AlvaScience in modo indipendente o come suite di strumenti per affrontare l'intero flusso di lavoro QSAR.

Il componente alvaMolecule è stato concepito come un foglio di lavoro molecolare in cui i set di dati molecolari possono essere visualizzati sia come una griglia di molecole che come un foglio di calcolo; i dati aggiuntivi forniti nei file SMILES e MDL vengono importati automaticamente e possono essere utilizzati, insieme ai descrittori calcolati e alle proprietà fisico-chimiche, per ordinare e filtrare il set di dati molecolari.

Deposito CDDè una piattaforma informatica completa che aiuta i team di progetto a gestire, analizzare e presentare dati per aziende biotecnologiche, CRO, laboratori accademici, ospedali di ricerca, aziende agrochimiche e di beni di consumo.

Costruito per i team di scoperta di farmaci, CDD Vault afferma che l'interfaccia web è intuitiva per i principianti e potente per gli utenti esperti, consentendo la migrazione dei dati senza richiedere alcuna competenza IT. CDD Vault consente agli utenti di accedere a tutti i propri dati di ricerca da qualsiasi browser Web moderno. Possono cercare qualsiasi esperimento o esplorare i risultati nelle tabelle e nei grafici SAR. Filtra, codifica a colori ed evidenzia le sottostrutture per individuare rapidamente i modelli.

CDD Vault viene fornito come soluzione ospitata economicamente vantaggiosa per laboratori accademici, start-up e aziende biofarmaceutiche. CDD Vault viene fornito con supporto interno e può espandersi man mano che i team crescono.